國內專門從事醫院建筑設計的專業設計院并不多，而專門從事醫院建筑設計的人員中，大多對空氣凈化專業方面的知識較為有限。一次讓設計院來進行具有指導性、權威性的設計不太可行。
    醫用凈化工程承包商有一定的專業設計能力，但由于設計取費較低，對建筑設計院分包出來的凈化專業設計任務缺乏積極性。
    在實踐中，大多數醫院凈化工程的設計都是交由車間凈化工程承包商來完成，再由建筑設計院“套圖框”確認，建筑設計院僅從平面布局、水電暖預留量是否足夠等方面進行宏觀性的設計復核，對凈化工程設計施工圖缺少真正意義上的審核把關。這些參與過設計的承包商又來承攬施工，既獲得了招投標環節信息上的優勢，又為日后可能發生的設計變更留下伏筆。
    醫院凈化工程的項目工作多數是由擁有綜合資質的項目公司實施，它們的專業項目人員多是建筑或安裝專業的技術人員。但醫院的凈化工程是由工程學、衛生學、生物感染控制學等專業學科相結合的復雜多系統工程。其中如空氣凈化、醫用氣體、自動控制、污染控制等專業知識是絕大多數工程監理公司平時很難接觸到的，因此，很難有效的進行監理指導。